美国研究团队使用CRISPR-CATCH技术,实现对染色体外DNA的靶向分析

2022-10-21  美国 来源:其他 作者:张芮晴 领域:生物

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据生物世界公众号10月18日消息,美国斯坦福大学的研究团队使用基于CRISPR-Cas9的染色体片段靶向技术“CRISPR-CATCH”,实现了对百万碱基对级别的人类染色体外DNA(ecDNA)的靶向克隆和分析。染色体外DNA(ecDNA)是一种常见的癌基因扩增模式,与癌症及靶向治疗耐药性密切相关。由于ecDNA的巨大尺寸和序列复杂性,对其靶向克隆和分析存在挑战性。使用CRISPR-CATCH对ecDNA进行靶向分析,可以深入了解ecDNA的结构、多样性、起源和表观基因组景观,有助于阐明ecDNA中的致癌基因扩增在癌细胞中是如何被调节的。相关研究成果发表于Nature Genetics期刊。

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