法国科研团队利用ML-MM混合方法提高基因组规模代谢模型的预测能力

2023-08-23  法国 来源:其他 作者:戴吉 领域:生物

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据ScienceAI网8月18日消息,法国巴黎萨克雷大学科研团队结合机器学习(ML)和机械建模(MM)开发出MM-ML混合模型,提高了基因组规模代谢模型(GEM)上基于约束的建模(CBM)的性能。该混合模型可通过直接训练对MM方法进行参数化来提高MM的可预测性,同时MM的约束还可使ML方法能够通过在较小的数据集上进行训练来克服维数诅咒,适用于系统生物学和代谢工程中的常见任务,如预测培养基生长或基因敲除(KO)的生物体的定性和定量表型等。该研究可改进基于约束的机械模型和黑盒机器学习模型,也可应用于基于微生物的决策装置的工程等工业应用。相关研究成果发表于Nature Communications期刊。

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