百度提出蛋白质结构新算法可大幅提高预测效率实现秒级预测

2023-10-13  中国 来源:其他 作者:戴吉 领域:生物

关键词:

据Nature官网10月9日消息,百度飞桨螺旋桨联合百图生科开发出蛋白质结构预测大模型HelixFold-Single,大幅缩短蛋白质结构预测时间,实现了秒级预测。该团队将大规模蛋白质语言模型与AlphaFold2的几何学习能力相结合,利用自监督学习范式通过3亿数据预训练了一个具有数千万个初级结构的大规模蛋白质语言模型,可通过一级结构快速预测原子的三维坐标,预测AlphaFold2预测需1280秒的以门蛋白7et2_H仅需11秒,速度提高115倍。该模型打破了主流蛋白质结构预测方法依赖于多序列对比检索模型的速度瓶颈,并可应用于多肽、抗体、纳米抗体等大分子药物的设计和有效性验证,提高大分子创新药的探索效率。相关研究成果发表于Nature Biomedical Engineering期刊。


消息来源:https://www.nature.com/articles/s42256-023-00721-6