2025-05-07 美国 来源:全球生物防御网 作者:张芮晴 领域:生物
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据全球生物防御网5月2日消息,美国疾控中心(CDC)为污水基因组监测开发新工具Aquascope,可帮助检测废水中的COVID-19变体,为病毒在社区传播提供早期预警。该工具内置Nextflow,可实现高性能与云计算集成;采用容器化的开源工具进行质量控制、变异检测和谱系丰度估计;提供可重复性、可扩展性及与现有CDC数据平台的集成;架构支持集成多种病原体条形码库,可实现更广泛的公共卫生应用。
https://globalbiodefense.com/2025/05/02/flushing-out-variants-genomic-surveillance-of-sars-cov-2-via-national-wastewater-monitoring/